IBIS politiske ledelse vælges hvert år på generalforsamligen. De 14 medlemmer udgør IBIS' styrelse, som tager de overordnede beslutninger og sætter rammerne for IBIS´ arbejde.
Styrelsen vælger en formand/kvinde og næstformand/kvinde, og nedsætter de nødvendige udvalg.
Forretningsudvalget er ansvarlig for IBIS økonomi, personale og drift osv.
Programudvalget arbejder hovedsageligt med strategier og temaprogrammer, metode og evaluering.
Midlertidige tematiske udvalg nedsættes efter behov. Lige nu fokuserer et udvalg på en strategi for IBIS' arbejde i Danmark.